Obtienen los primeros genomas completos del virus SARS-CoV2 en España y no muestran mutaciones

La Universitat de València (UV) y la Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunitat Valenciana (Fisabio) han obtenido los primeros genomas completos del virus SARS-CoV2 en España.
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rnLa secuenciación del genoma del virus permite conocer las mutaciones que ha sufrido desde que comenzó la epidemia y la conclusión a la que se ha llegado después del análisis realizado es que, hasta ahora, no se ha encontrado ninguna mutación asociada a una mayor virulencia, letalidad o a alguna propiedad interesante desde el punto de vista clínico.
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rnLos equipos de investigación valencianos han conseguido secuenciar el genoma completo de tres muestras de pacientes infectados por el Covid-19 procedentes del laboratorio de Microbiología del Hospital Clínico Universitario de València, las primeras secuencias del virus SARS-CoV2 obtenidas en España.
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rnSegún ha informado la UV en un comunicado, esta secuenciación de genomas completos se suma al esfuerzo que se está haciendo a nivel mundial en todos los laboratorios para averiguar cuáles han sido las vías de transmisión y cómo se extienden los diferentes linajes del virus.
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rnEl análisis genómico ha sido llevado a cabo por la Unidad Mixta en Infección y Salud Pública de la UV y el Grupo de Investigación en Epidemiología Molecular de Fisabio, ambos liderados por Fernando González, catedrático de Genética e investigador, y el Servicio de Secuenciación y Bioinformática de Fisabio que coordinan Giuseppe d’Auria y Llúcia Martínez.
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rn"El objetivo primordial es identificar con mayor fiabilidad los focos y las cadenas de transmisión del coronavirus. La principal conclusión del análisis de las primeras muestras es que las cepas proceden de rutas de transmisión diferentes", ha explicado González.
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rnLos grupos, formados por personal investigador especialista en virología, epidemiología y bioinformática, han determinado que una de las cepas analizadas está relacionada con otras cepas europeas (de Italia, Alemania, Luxemburgo, Francia, Escocia, Países Bajos...)
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rn"El siguiente paso será analizar secuencias de más muestras de pacientes de los hospitales de la Comunitat Valenciana para poder comprobar las vinculaciones entre ellas y con las cadenas de transmisión establecidas por el personal especialista en epidemiología", ha señalado González.
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rnEl análisis de genomas virales permite conocer las vías por las cuales ha entrado el virus y cómo se transmite en estos momentos, lo que ayudará a las autoridades sanitarias a controlar mucho mejor la expansión del virus.
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rnLas secuencias ya están accesibles en la base de datos de la Iniciativa Gisaid, consorcio público dedicado al estudio del virus de la gripe; la plataforma Nextstrain, que permite visualizar la progresión espacial y temporal de la pandemia a partir de los más de 500 genomas depositados desde el pasado diciembre por 40 países; y la base de datos Genbank de secuencias genéticas del National Institutes of Health (NIH) de Estados Unidos.
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rnLas muestras han sido secuenciadas mediante MinIOn, un secuenciador de tercera generación de Oxford Nanopore Technologies. La infraestructura utilizada en la investigación ha sido posible gracias a la cofinanciación de la Unión Europea a través del Programa Operativo del Fondo Europeo de Desarrollo Regional (Feder) de la Comunitat Valenciana 2014-2020.